地铁西直门站2号线、4号线共用五个出入口,13号线有四个出入口,均由北京地铁运营公司负责。其中出站口A2(单向通行)、进站口A1(双向通行)位于北京北站广场上及嘉茂商场的下沉广场。需要搭乘地铁换乘的到站旅客,可至嘉茂商场的下沉广场西侧进站口A1进站,搭乘13号线的旅客可从E口进站。